A. miRNA电泳检测(miREFA),miRNA横流层析检测见相关网页。
MicroRNA(miRNA)为长度为18-23个碱基的单链核苷酸,参与细胞增殖、分化和死亡等生物过程,与许多疾病相关并可能成为疾病的生物标志物,为现代生物学与生物医学热门研究领域[9-10]。
人类miRNA已发现有近5千种,以其中的miRNA21为例,在Google学术限定搜索“miR 21”,结果显示有428000篇文献报道(Fig.1)。相信以“miR21"“miRNA 21”或“miRNA21"名字发表的文章应该不少,可见miRNA的研究之热度。
现已开发了多种检测 miRNA 的技术,包括用放射性标记的探针进行 RNA 印迹分析[11],基于微阵列[12]和基于聚合酶链式反应(PCR)的方法[13],液相单细胞测定[14],原位杂交[15-16]和高通量测序[17]等。然而,这些方法都有其固有的局限性,但是检测 miRNA 依然面临着重大挑战。
Northern印迹法曾经是检测miRNA的,广泛使用标准方法,可以检测miRNA的相对分子大小和丰度,但其也存在低通量、耗时长、易降解等缺点,并且敏感度较低,无法检测到分子量较低的miRNA。
实时定量PCR(quantitativereal-timePCR,qRT- PCR)具有动态范围大、灵敏度高、序列特异性强等优点,已成为检测miRNA表达的常规和可靠技术。 但qRT-PCR测定的miRNA并非样品的实际表达量,难于区分miRNA之间的单核苷酸差异,并且还有假阳性以及引物设计困难的问题。
微阵列技术是一种快速、高通量检测miRNAs的方法,但成本高,不能检测分子量较低的miRNA,对序列相似的miRNA的分辨性不好,也有假阳性问题。
一些学者开发了各种等温分析技术,包括滚环扩
增(RCA),指数扩增反应(EXPAR),环介导的等温扩增(LAMP),杂交链反应和催化发夹组装。尽管这些测定具有简单甚至无需仪器操作的优点,但也存在限制其广泛应用的缺点,例如EXPAR和LAMP的非特异性扩增和高背景信号,以及杂交链反应和催化发夹组装的相对较慢的动力学和低灵敏度。
B. miREFA的技术优势
微奥基因(viagene)公司开发的快速microRNA Electrophoretic Fluorescence Assay (miREFA) 是检测miRNA的有力工具,其工作原理是基于分子杂交,未杂交的探针比与RNA/DNA与探针的杂交体的分子量小,导致在高分辨率变性聚丙烯酰胺凝胶中移动速度变化,游离探针与杂交体位置不同,探针在电泳胶中的位置通过荧光标记物在荧光扫描仪或成像仪显现。 MiREFA具有以下优势与特点。
1)快速出结果:miREFA技术能够使分子杂交在短时间内完成,全部测定包括电泳可以在2小时内完成(Fig.2,时间安排)。
2)灵敏度高:miREFA kits使用近红外标记探针,并采用特殊方法大大提高检测灵敏度,能够测定飞克摩水平的miRNA(Fig.3
3)操作简便:miREFA在现有miRNA检测方法中为最简便的操作技术,简单操作与快速出结果能大大降低样品降解(见操作说明书)。
4)分辨率高:miREFA技术能够分辨同种miRNA间的单个碱基长短变化(图4),能鉴别区分单个碱基突变,也能区分miRNA前体与成熟miRNA。
5)样品绝对量检测:miREFA所测定的是单位样品体积中的miRNA绝对量,不涉及任何扩增、放大。
6)定量检测:miREFA能够对所测定的miRNA进行定量分析。
C. miREFA所需要的试剂与条件:
1)荧光标记探针:微奥基因的即用kit已包括探针,客户也可向我们定制个性化探针。
2)需要能使探针与目标分子快速杂交的试剂以及用于检测miRNA的电泳系统,微奥基因的即用kti已包括所有试剂。
3)需要米REFA专用垂直电泳预制胶(微奥基因产品,选购项)或按照说明用Kit所带试剂配置专用变性胶。
5)客户需要自备能够对IR700荧光进行图像扫描的仪器(如Li Cor公司的Odyssey 近红外荧光扫描仪)或任何能够检测700nm荧光的成像仪(客户自备)。
微奥基因提供的快速miRNA检测技术涉及多项美国专利与技术秘密。由于时间有限,现仅提供有限类别的miRNA测定Kits,如Let-7、miRNA21、MiRNA122、MiRNA144,MiRNA145、MiRNA155的检测。
为使客户能够开展其它类别的mRNA检测,现开展为期两个月的优惠活动;凡是订购我司尚未开发的miRNA检测,客户在购买miREFA通用试剂基础上,个性化订购检测miRNA的探针享受50%优惠(miRNA检测探针涉及多个荧光分子标记,正常价格2100元)。
微奥基因的miRNA测定Kits按标签显示温度存放,可以保存一年。